Biologiske behandlingsprocesser kræver et stabilt mikrobielt miljø i reaktionssystemet. Dette kræver typisk opretholdelse af en høj slamkoncentration (MLSS) og en passende slamretentionstid (SRT) for at sikre tilstrækkelig nedbrydning af organisk stof og ammoniaknitrogen. Samtidig bør den indflydende kvalitet være så afbalanceret som muligt for at undgå for store stødbelastninger, hvilket kan have en negativ indvirkning på mikrobiel aktivitet og den samlede behandlingseffektivitet.
Membrandriftsprocesser kræver streng kontrol af transmembran trykdifferens (TMP) og membranflux. Drift med konstant flux eller konstant tryk anvendes generelt under drift, med realtidsovervågning af TMP-ændringer for at vurdere membranbegroning. Hvis trykket stiger eller fluxen falder, er rettidig tilbageskylning eller kemisk rensning nødvendig for at genoprette membranens ydeevne og forhindre irreversibel tilsmudsning.
Membrantilsmudsningskontrol har specifikke krav til beluftning og hydrauliske forhold. Beluftningssystemet skal kontinuerligt give tilstrækkelig forskydningskraft til at reducere slamaflejring på membranoverfladen; Samtidig skal den hydrauliske retentionstid (HRT) og returforholdet kontrolleres korrekt for at undgå overdreven slamakkumulering eller systembelastningsubalance. Overordnet set lægger proceskravene til Membrane bioreactor vægt på afbalanceret systemdrift og raffineret kontrol, som er nøglen til at opnå stabilt spildevand og langsigtet-drift.